TALLER INFORMES ESTRUCTURADOS MULTIPROPÓSITO
MIÉRCOLES 25 DE MAYO, 8:30-10:00
Juan Calabia del Campo
Sala Multiusos 4
Para asistencia se precisa reserva de plaza a través del formulario de inscripción online, asignación de plazas por riguroso orden de llegada de petición. Una vez inscrito al taller se le facilitará el material vía email.
Contexto:
La generación de informes estructurados y homogéneos está cobrando una importancia creciente en la actualidad, especialmente debido a su capacidad para garantizar una calidad contrastable y para generar datos estructurados de una manera robusta y reproducible.
En este taller se mostrará el proceso de diseño, personalización y ejecución de informes estructurados, con la incorporación de datos cuantitativos procedentes de calculadoras, que permitan mejorar la calidad y la reproducibilidad, así como mejorar la presentación y la comunicación con el paciente y otros profesionales.
Objetivos docentes del taller:
- Mostrar, de manera práctica, algunos de los pasos que intervienen en el proceso del diseño de informes, protocolos y calculadoras a partir de imagen médica
- Aprender a manejar herramientas software para la generación de informes estructurados.
Número de participantes mínimo/máximo: 5/30
Material que debe aportar el participante:
- Ordenador portátil
- Casos de ejemplo con informes BI-RADS/ PI-RADS (se proporcionarán a los participantes para su descarga con antelación al inicio del curso).
Procedimiento:
- El taller tendrá una buena parte de su actividad de manera previa a la sesión presencial en el congreso.
- Se facilitará a los asistentes tras su inscripción al taller (se informará a los inscritos al Congreso de la apertura y formulario de solicitud de plaza taller) instrucciones para la descarga e instalación del software necesario en los ordenadores de los participantes, que podrán consultar sus dudas y dificultades.
- Tras la inscripción y dados de alta en la plataforma web, los participantes se podrán descargar casos de ejemplo junto con instrucciones.
- En el taller presencial se llevará a cabo un flujo completo de procesado de datos para la presentación, la docencia y la manipulación de datos. Se proporcionarán resultados parciales por si hubiera dificultades en el transcurso del taller. Se realizará un informe común de un caso clínico, sobre el que se analizará su reproducibilidad y validación.
- Se creará un informe estructurado para uso público.
TALLER FREESURFER
JUEVES 26 DE MAYO, 8:30-10:00
Álvaro Planchuelo Gómez
Sala Multiusos 4
Para asistencia se precisa reserva de plaza a través del formulario de inscripción online, asignación de plazas por riguroso orden de llegada de petición. Una vez inscrito al taller se le facilitará el material vía email.
Contexto:
Freesurfer es una herramienta software de código libre para el análisis y la visualización de neuroimagen. Su potencia y versatilidad lo han convertido en casi un estándar de facto para muchas tareas de análisis cuantitativo en imagen cerebral.
Objetivos docentes del taller:
- Aprender a instalar y configurar Freesurfer en sus equipos
- Manejar las funcionalidades principales de Freesurfer para el análisis de resonancia cerebral
- Comprender los usos y aplicaciones que puede tener el análisis proporcionado por Freesurfer, y aprender a analizar y visualizar los resultados
Número de participantes mínimo/máximo: 5/40
Material que debe aportar el participante:
- Ordenador portátil con sistema operativo MacOS
- Software libre Freesurfer instalado en el ordenador de manera previa al inicio del taller (se proporcionarán instrucciones con antelación)
- Casos de ejemplo descargados (se proporcionarán también con antelación)
Procedimiento
- El taller tendrá buena parte de su actividad de manera previa a la sesión presencial en el congreso.
- Se facilitará a los asistentes tras su inscripción al taller (se informará a los inscritos al Congreso de la apertura y formulario de solicitud de plaza taller) las instrucciones para la descarga e instalación del software Freesurfer en los ordenadores de los participantes.
- Tras la instalación, los participantes se podrán descargar casos de ejemplo junto con instrucciones de cómo ejecutar diferentes tipos de análisis sobre los casos de ejemplo. No es viable hacer esto durante el taller porque la ejecución de estos procesos de análisis puede durar muchas horas.
- En el taller presencial se explicarán los resultados obtenidos, las dificultades que puede haber (casos con lesiones de cierto tamaño, hidrocefalia, etc), cómo analizarlos, etc.
TALLER IMPRESIÓN 3D
VIERNES 27 DE MAYO, 8:30-10:00
Javier Manzano Mozo
Sala Multiusos 4
Para asistencia se precisa reserva de plaza a través del formulario de inscripción online, asignación de plazas por riguroso orden de llegada de petición. Una vez inscrito al taller se le facilitará el material vía email.
Contexto:
El proceso de obtención un objeto físico impreso en 3D a partir de una imagen médica (DICOM)1,2 supone una serie de procesos en los que intervienen distintas herramientas informáticas. En este taller se mostrarán todos estos procesos además de proponer distintas herramientas para la realización de todo el proceso.
Objetivos docentes del taller:
- Mostrar, de manera práctica, algunos de los pasos que intervienen en el proceso de impresión 3D a partir de imagen médica
- Aprender a instalar y manejar algunas utilidades software que pueden ser utilizadas en el contexto de la impresión 3D
Número de participantes mínimo/máximo: 5/40
Material que debe aportar el participante:
- Ordenador portátil
- Software libre ITK-Snap y Meshlab instalados en el ordenador de manera previa al inicio del taller (se proporcionarán instrucciones con antelación)
- Casos de ejemplo descargados (se proporcionarán también con antelación)
Procedimiento:
- El taller tendrá una buena parte de su actividad de manera previa a la sesión presencial en el congreso.
- Se facilitará a los asistentes tras su inscripción al taller (se informará a los inscritos al Congreso de la apertura y formulario de solicitud de plaza taller) las instrucciones para la descarga e instalación del software necesario en los ordenadores de los participantes y dificultades. Este software será probablemente ITK-Snap y Meshlab, aunque aún se están considerando otras alternativas.
- Tras la instalación, los participantes se podrán descargar casos de ejemplo junto con instrucciones.
- En el taller presencial se llevará a cabo un flujo completo de procesado de datos para impresión. Se proporcionarán resultados parciales por si hubiera dificultades en el transcurso del taller.
[1] Mitsouras, D., Liacouras, P., Imanzadeh, A., Giannopoulos, A. A., Cai, T., Kumamaru, K. K., ... & Ho, V. B. (2015). Medical 3D printing for the radiologist. Radiographics, 35(7), 1965-1988.
[2] Rengier, F., Mehndiratta, A., Von Tengg-Kobligk, H., Zechmann, C. M., Unterhinninghofen, R., Kauczor, H. U., & Giesel, F. L. (2010). 3D printing based on imaging data: review of medical applications. International journal of computer assisted radiology and surgery, 5(4), 335-341
TALLER RADIOMICS
SÁBADO 28 DE MAYO, 8:30-10:00
Carlos Alberola López
Sala Multiusos 4
Para asistencia se precisa reserva de plaza a través del formulario de inscripción online, asignación de plazas por riguroso orden de llegada de petición. Una vez inscrito al taller se le facilitará el material vía email.
Contexto:
El término “Radiomics” se acuñó en el año 2012[3] en el ámbito de la oncología, si bien tiene aplicabilidad potencial en todo tipo de patología. Este término parte de la idea de que las imágenes deben dejar de ser consideradas como fotografías para pasar a interpretarse como una fuente de información numérica[4]; esta información permitirá definir descriptores, los cuales puedan combinarse con otras fuentes —como la historia del paciente o su información genética— para dar lugar a un vector de características numéricas sobre las que poder llevar a cabo algún tipo de inferencia estadística e incorporar las conclusiones de este análisis a un informe radiológico.
Objetivos docentes del taller:
- Comprender en profundidad el concepto de Radiomics y sus aplicaciones
- Aprender a instalar y manejar algunas utilidades software que pueden ser utilizadas en el contexto de Radiomics
- Llevar a cabo un flujo completo de Radiomics, compuesto por segmentación, cálculo de características radiómicas, análisis estadístico y boceto de un informe que incorpore dicho análisis.
Número de participantes mínimo/máximo: 5/40
Material que debe aportar el participante:
- Ordenador portátil
- Software libre ITK-Snap y R-Studio instalados en el ordenador de manera previa al inicio del taller (se proporcionarán instrucciones con antelación)
- Casos de ejemplo descargados (se proporcionarán también con antelación)ç
Procedimiento
- El taller tendrá buena parte de su actividad de manera previa a la sesión presencial en el congreso.
- Se facilitará a los asistentes tras su inscripción al taller (se informará a los inscritos al Congreso de la apertura y formulario de solicitud de plaza taller) instrucciones para la descarga e instalación del software necesario en los ordenadores de los participantes. Este software será probablemente ITK-Snap y RStudio, aunque aún se están considerando otras alternativas.
- Tras la instalación, los participantes se podrán descargar casos de ejemplo junto con instrucciones.
- En el taller presencial se llevará a cabo un flujo completo de Radiomics, compuesto por segmentación, cálculo de características radiómicas, análisis estadístico y boceto de un informe que incorpore dicho análisis. Se proporcionarán resultados parciales por si hubiera dificultades en el transcurso del taller.
[3] Lambin, Philippe; Rios-Velazquez, Emmanuel; Leijenaar, Ralph; Carvalho, Sara; Van Stiphout, Ruud G.P.M; Granton, Patrick; Zegers, Catharina M.L; Gillies, Robert; Boellard, Ronald; Dekker, André; Aerts, Hugo J.W.L (2012). "Radiomics: Extracting more information from medical images using advanced feature analysis". European Journal of Cancer. 48 (4): 441–446.
[4] Gillies, R. J., Kinahan, P. E., & Hricak, H. (2016). Radiomics: images are more than pictures, they are data. Radiology, 278(2), 563-577.